انتخاب اسلات M.2 برای نصب SSD فقط به محل قرارگیری حافظه و راحتی دسترسی به آن مربوط نیست؛ در بعضی مادربوردها، استفاده از یک اسلات اشتباه می‌تواند تعداد خطوط ارتباطی کارت گرافیک را کاهش دهد و آن را از x16 به x8 برساند. این محدودیت به نحوه تقسیم خطوط PCIe بین پردازنده، اسلات‌های M.2 و درگاه کارت گرافیک بستگی دارد.

نکته مهم این است که نصف شدن پهنای باند لزوماً به معنی نصف شدن سرعت بازی یا افت ۵۰ درصدی عملکرد کارت گرافیک نیست؛ اما اگر مادربورد شما از چنین اشتراک منابعی استفاده کند، بهتر است SSD را در اسلاتی نصب کنید که ارتباط کارت گرافیک را محدود نمی‌کند.

یک اسلات M.2 خالی روی مادربورد فقط برای نصب SSD ساخته نشده است. بسته به نوع سوکت و مسیرهای ارتباطی مادربورد می‌توان از بعضی اسلات‌های M.2 برای افزودن قابلیت‌هایی مثل Wi-Fi، اترنت پرسرعت، کارت کپچر و حتی درگاه‌های بیشتر استفاده کرد. البته سازگاری کاملاً به نوع Key و رابطی که مادربورد برای آن اسلات در نظر گرفته بستگی دارد؛ همه اسلات‌های M.2 چنین قابلیتی ندارند.